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Évolution des techniques de séquençage, et exemples d'applications en microbiologie clinique
Il y a une cinquantaine d'années, le développement par Sanger et al. d'une technique de séquençage de l'ADN a permis de décrypter des génomes dans tous les domaines du vivant dont celui de l'Homme, et a ainsi révolutionné la biologie. Depuis le milieu des années 2000, le développ...
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| Auteurs principaux : | , , , , , |
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| Collectivités auteurs : | , |
| Format : | Thèse ou mémoire |
| Langue : | français |
| Titre complet : | Évolution des techniques de séquençage, et exemples d'applications en microbiologie clinique / Sarah Marchand; sous la direction de Berthe-Marie Imbert |
| Publié : |
2023 |
| Accès en ligne : |
Accès Nantes Université
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| Note sur l'URL : | Accès réservé aux étudiants et personnels de l'Université de Nantes après authentification |
| Note de thèse : | Thèse d'exercice : Pharmacie : Nantes : 2022 |
| Conditions d'accès : | Accès réservé aux étudiants, personnels de l'Université de Nantes et lecteurs inscrits, après authentification. |
| Sujets : |
| Résumé : | Il y a une cinquantaine d'années, le développement par Sanger et al. d'une technique de séquençage de l'ADN a permis de décrypter des génomes dans tous les domaines du vivant dont celui de l'Homme, et a ainsi révolutionné la biologie. Depuis le milieu des années 2000, le développement des technologies de séquençage de deuxième génération (NGS, next generation sequencing) a fait chuter le coût du séquençage à haut débit et l'a mis à la portée des laboratoires de biologie médicale. Puis, le récent déploiement de méthodes dites de troisième génération ou long-read a offert de nouvelles possibilités de séquençage. Utilisées dans un premier temps pour la recherche, le champ d'application potentiel de ces technologies à haut débit s'étend désormais au diagnostic médical et apporte de nouvelles approches diagnostiques et pronostiques pour certaines pathologies comme celles infectieuses. Cette thèse bibliographique vise à exposer de façon synthétique les principales technologies de séquençage de l'ADN, de la première à la troisième génération, avec pour chacune un descriptif schématisé et détaillé de son fonctionnement. Boite à outils puissante pour l'exploration des génomes, son utilisation croissante en microbiologie clinique permet d'identifier et de caractériser des agents pathogènes potentiellement responsables de maladies infectieuses. Ainsi, la dernière partie de cette thèse expose les différentes stratégies et applications possibles du séquençage de l'ADN en microbiologie clinique. |
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| Notes : | Thèse présentée et soutenue publiquement le 14 octobre 2022 Description d'après la consultation, 2023-01-26 Titre provenant de la page de titre du document électronique Le nom de l'organisme de soutenance a changé au 01/01/2022, ce changement n'apparaît pas sur la page de titre Thèse présentée et soutenue publiquement en 2022 et mise en ligne en 2023 L'impression du document génère 68 p. Autre (s) contribution (s) : Virginie Ferre (Président du jury) ; Marc Denis, Stéphane Corvec, Céline Bressollette (Membres du jury) |
| Configuration requise : | Un logiciel capable de lire un fichier au format PDF |
| Bibliographie : | Bibliogr. 135 réf. |